重庆市人民医院三院院区前身是1929年创立的国民政府中央医院,1939年迁至重庆。1945年在学田湾设立国民政府中央医院城区门诊部,1947年该门诊部迁至现址,更名为国民政府中央医院重庆城区分院,1950年后相继整编为西南军政委员会、西南行政委员会直属医院。1951年负责西南局机关干部医疗保健工作,1954年设置全市唯一一家地专级以上高级干部病房(直至20世纪80年代),1955年正式命名为重庆市第三人民医院。1985年成为重庆市唯一的副厅级医院,1991年增挂重庆市老年病防治研究所,1993年成为全市首批三级甲等医院,1997年增挂重庆市临床检验中心,2003年增挂重庆市眼耳鼻咽喉科医院,2006年增挂重庆中俄友好医院。


医院学科门类齐全、优势学科集聚。拥有国家神经系统疾病临床医学研究中心重庆分中心、重庆市心肺血管疾病医疗研究所、重庆市老年病防治研究所、重庆市骨伤骨病医疗中心、重庆市临床检验中心、重庆市眼耳鼻咽喉科医院、重庆市博士后科研工作站等,为持续提升医疗服务能力和医学学科发展提供了坚实基础。医院现有临床医技科室56个,拥有1项国家疑难病症诊治能力提升工程项目(心血管外科),1个国家临床重点专科(过敏反应科),5个重庆市医学重点学科(心血管外科、骨科、老年病学科、耳鼻咽喉科学、医学检验科),14个重庆市临床重点专科(重症医学科、检验科、麻醉科、呼吸内科、骨科、老年病科、医学影像科、神经外科、消化内科、神经内科、心血管内科、普通外科、心胸外科、肿瘤科),1个重庆市特色医学专科(康复医学科),4个临床研究中心(心血管外科学、检验医学、耳鼻咽喉学、老年疾病学),5个国家及重庆市重点实验室(国家发改委血管植入物工程实验室、肾脏病透析治疗研究室、临床检验质量控制研究室、结核基因诊断中心实验室、神经变性病实验室)。医院形成了以心血管外科、耳鼻咽喉头颈外科、骨科、肝胆胰腺外科、乳腺甲状腺外科、老年病科、医学检验科为主的具有重要影响力的学科群。


医院高端人才汇集、专业实力雄厚。现有职工2500余人,其中专业技术人员2100余人,双聘院士1人,高级职称近400人,博士70余人,拥有一批国务院政府特殊津贴专家、重庆市突出贡献专家、市级学术技术带头人以及博士、硕士研究生兼职导师,是国家住院医师规范化培训基地、国家临床药师规范化培训基地、国家药物及医疗器械临床试验机构、重庆市护士规范化培训基地。