南京市秦淮中医院成立于1956年，集中中医医疗、教研、康复保健为一体的二级中医院。医院设有内、外、妇、儿、针灸、康复、男性、骨伤、计划生育、社会保健等临床科室，配有500毫安X机、彩色B超、全自动生化仪等检验设备，并设床位80张，并开展社区卫生服务等项目。


多年来，医院坚持中医专科专病特色办院方向，强化科学管理，狠抓内涵建设，优化服务质量，突出科技创新，以良好医德医风和精湛医术为广大患者提供优质服务，让病人满意在我院。医院中医妇科是南京市重点专科，形成以省名中医胥受天、胥京生主任医师领军的学术梯队，在妇科病诊治中，对男女不孕（育）症、子宫肌瘤、习惯性流产、宫颈炎、功能性子宫出血等病制定了一套完整的系列治疗，并形成自己独特的学术特色。同时开展各种门诊手术，中西医结合，疗效满意。慕名前来的患者有全国各地及港澳台地区，妇科年门诊量逾13万人次。妇科还十分重视科研，先后在、国内学术刊物及学术会议上发表论文50篇，不少论文获国内成果奖，出版专著10多部，有省市科研项目３项。其中《化瘤合剂治疗子宫肌瘤应用研究》2004年被评为全国现代中医药科技进步一等奖。医院针灸康复科也是南京市重点专科。该科位于医院的二楼和五楼，分别由针灸治疗室、康复治疗室、理疗室、灸疗室、牵引室、住院部等几部分组成。该科坚持走中医特色之路，不断挖掘祖国医学之精髓。在针刺的同时，大量运用“艾灸”法，并创立了南京市家“灸疗室”，目前广泛应用于临床治疗的有“动力灸”、“温箱灸”、“隔物灸”、“艾炷灸”、“骑竹马灸”等十余种灸法，形成了专科特色疗法。除针灸外还采用康复煅练、正骨、推拿、整脊、耳压、水针、皮肤针、封闭、理疗、牵引、蜡疗、薰蒸等多种方法对患者进行综合治疗。深受广大患者信赖与欢迎。


医院以病人为中心为患者提高优质满意服务，多次被评为“平安秦淮建设”、“居家保健卡医疗单位”、“计量合格确认单位”、“南京市中医药大学针灸培训中心临床实习基地”、“医院管理工作先进单位”、“秦淮区卫生系统文明示范窗口”、“价格调控和治乱减负工作先进单位”、"江苏省文明单位”、“明码实价诚售药房创建活动优胜单位”“物价信得过单位”“三信三优单位”“市行风建设先进单位”等荣誉称号。