武威医学科学院下属甘肃省武威肿瘤医院、武威消化病医院、武威肝病医院（武威肝胆中心）、武威心脏血管病专科医院、武威市体检中心、武威重离子中心等分支机构。编制床位1000张，年门诊量35万人次，住院治疗2.8万人次。现为兰州大学、河西学院、武威职业学院临床教学医院，也是兰州大学硕士研究生培养点。现承担省部级科研项目7项，共获得省级各种奖23项，市级科研项目94项，获国家专利69项，形成了以消化系统疾病、心脏血管系统疾病、肿瘤疾病为诊疗特色的现代化品牌医院。

医院现有职工1360人，其中卫生技术人员975人，高级职称100余人，中级职称200余人，硕士以上学历人才63人，兰州大学硕士生导师2名，兼职教授6名。拥有国内首台自主知识产权的重离子治疗肿瘤系统、瓦里安Vital Beam直线加速器、瓦里安Clinac CX直线加速器、医科达Infinity“可视化”四维影像引导医用直线加速器、西门子64排模拟定位CT、Discovery 710 Clarity大型PET/CT、西门子MAGNETOM Skyra 3.0T超音速高端放疗定位磁共振、美国GE动态500排宝石能谱CT 、西门子3.0T核磁共振、西门子S2000ABVS高端彩色多普勒超声波诊断仪等高新设备250余台，设备装配水平居省内先进水平。